人肠道中的细菌可分为两类：一类是“固有菌”，如乳酸杆菌等，它们长居肠中，犹如一道天然防线，可抵御外来病菌的侵害；另一类叫“条件致病菌”，如大肠杆菌、肠球菌、葡萄球菌等。“条件致病菌”因受“固有菌”制约，一般情况下无致病作用，而且还参与协调肠道的消化功能。

过敏性肠炎的发生与肠道中一些细菌减少有密切关系。科学家通过饮食中钙对过敏性肠炎作用的研究发现，钙能影响肠道细菌数量的分布。比如，当钙减少或不足时，肠道中“固有菌”也会相应减少，肠道防御功能会减弱，而“条件致病菌”也会因此失去制约而自由生长、繁殖，导致肠道菌群失调，引起肠道病变。这时，如投入适量钙剂，即可使“固有菌”数量增加，“条件致病菌”受到抑制，数量也会减少，从而使肠道菌群趋于平衡，消除了过敏反应，肠道功能也开始正常。