1、粪便常规检查：大便显微镜检查，注意有无脓细胞、白细胞、红细胞与吞噬细胞，还应注意有无虫卵、寄生虫、真菌孢子和菌丝。

2、大便培养：对确定腹泻病原有重要意义。一次粪便培养阳性率较低，需多做几次，新鲜标本立即培养可提高阳性检出率。

3、大便乳胶凝集试验：对某些病毒性肠炎有诊断价值，如轮状病毒、肠道腺病毒等。有较好敏感性和特异性，对空肠弯曲菌肠炎的诊断有帮助。

4、酶联免疫吸附试验：对轮状病毒有高度敏感性、特异性。有助于轮状病毒肠炎和其他病毒性肠炎诊断。

5、聚丙烯酰凝胶（PAGE）电泳试验：此法可检测出轮状病毒亚群及不同电泳型，有助于轮状病毒分类和研究。

6、粪便还原糖检查：双糖消化吸收不良时，粪便还原糖呈阳性，pH值<6.0。还原糖检查可用改良斑氏试剂或Clinitest试纸比色。

7、粪便电镜检查：对某些病毒性肠炎有诊断价值。如轮状病毒性肠炎、诺沃克病毒性肠炎等。